2010 海洋生命・分子工学実験 II （遺伝子工学的実験法）
5 月 27〜28 日のデータ
塩基配列データ
サンプル番号をクリックして，塩基配列データを表示してください。
きれいに読めているサンプルでは，700 塩基ほど読めていますが，
画像には最初の 200 塩基ほどしか載せていません。全部を見たい人は
研究室に来てください。
全員が全部のサンプルを一度は参照して，自分以外のサンプルの結果に
ついても，考察をしてくださいね。
機械が自動的に配列を解読しようとするので，シグナルに対してノイズが
一定レベル以上になっているところは，GATC の配列じゃなくて 「N」 の
表示があります。しかし，慣れた人の目で見れば，正しく読める場合が
あります （つまり G か A か T か C かを判別できる場合があります）。
みんなも 「N」 となっているところが本当は何なのか，解読してみましょう。
配列データの画像では，塩基ごとに違う色でピークを表示していますが
みんなの中には，色を判別できない人もいると思います。このソフトでは
残念ながら色以外での区別はできないので，「N」 の修正に関しては，
私が手伝います。遠慮なく言ってください。もちろん，友だちどうしで助け
合ってくれても構いません。
それから配列の上に数字がありますが，それはプラスミド上の配列の位置
とも，プライマーの 5' 末端からの距離とも直接は対応していません。
機械が配列の解読を始めたスタートポイントから通し番号が付いています。
ちなみに，プライマー配列の部分は，原理的に，解読不可能であることは
わかりますよね？
あ。そうだ。 じゃあ，なぜプライマー部分の配列を，ピークとして読むことが
不可能なのかも，レポート課題にしましょう！
サンプル No. 1
サンプル No. 2
サンプル No. 3
サンプル No. 4
サンプル No. 5
サンプル No. 6
サンプル No. 7
サンプル No. 8
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